[ Diversité et polymorphisme génétiques de Coptodon zillii du lac de Sélingué (Mali) par l’utilisation des marqueurs microsatellites ]
Volume 70, Issue 1, December 2023, Pages 1–9
Nanourou Dembélé1, Youssouf Sanogo2, Adama Konaté3, Ramata Diop4, Hama Cisse5, Fassé Samaké6, and Diakaridia Traoré7
1 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
2 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
3 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
4 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
5 Unité de Formation et de Recherche en Sciences de la vie et de la Terre, Université Joseph KI-ZERBO, Ouagadougou, Burkina Faso
6 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
7 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
Original language: French
Copyright © 2023 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
The Sélingué hydroelectric dam is built on the Sankarani River in Mali. It is a fishing production area teeming with many fish species including Coptodon zillii. The species was selected for the study of genetic diversity. The study involved 120 specimens from two landing stages, Carrière in the lake area and Faraba near the Sankarani River. Each sample was subjected to DNA extraction from a caudal fin portion. Ten microsatellite markers were used and the genetic diversity of each locus analyzed. The results showed a number of alleles varying from 2 to 5 per marker with an average of 2.9. The loci were 70% polymorphic at the 95% cutoff. In total, 29 alleles were observed for all the samples with 2 groups on the dendrogram. Group I consists of 5% of the Faraba samples and Group II of the Carrière and 95% Faraba samples. In group II, there is a separation according to landing stages with little differentiation between the samples from the two sites. The expected heterozygosity (He=0.35) is lower than that observed (Ho=0.69), reflecting an excess of heterozygosity, with an absence of consanguinity and less significant gene exchange between the specimens of the two zones. These results show high polymorphism and genetic diversity in the samples studied. They offer basic elements on the knowledge of the genetic diversity of the species. However, the study could be extended to C. zillii populations throughout the lake and rivers.
Author Keywords: Coptodon zillii, microsatellite markers, diversity, heterozygote, polymorphism, Lake Sélingué, Mali.
Volume 70, Issue 1, December 2023, Pages 1–9
Nanourou Dembélé1, Youssouf Sanogo2, Adama Konaté3, Ramata Diop4, Hama Cisse5, Fassé Samaké6, and Diakaridia Traoré7
1 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
2 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
3 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
4 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
5 Unité de Formation et de Recherche en Sciences de la vie et de la Terre, Université Joseph KI-ZERBO, Ouagadougou, Burkina Faso
6 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
7 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
Original language: French
Copyright © 2023 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Abstract
The Sélingué hydroelectric dam is built on the Sankarani River in Mali. It is a fishing production area teeming with many fish species including Coptodon zillii. The species was selected for the study of genetic diversity. The study involved 120 specimens from two landing stages, Carrière in the lake area and Faraba near the Sankarani River. Each sample was subjected to DNA extraction from a caudal fin portion. Ten microsatellite markers were used and the genetic diversity of each locus analyzed. The results showed a number of alleles varying from 2 to 5 per marker with an average of 2.9. The loci were 70% polymorphic at the 95% cutoff. In total, 29 alleles were observed for all the samples with 2 groups on the dendrogram. Group I consists of 5% of the Faraba samples and Group II of the Carrière and 95% Faraba samples. In group II, there is a separation according to landing stages with little differentiation between the samples from the two sites. The expected heterozygosity (He=0.35) is lower than that observed (Ho=0.69), reflecting an excess of heterozygosity, with an absence of consanguinity and less significant gene exchange between the specimens of the two zones. These results show high polymorphism and genetic diversity in the samples studied. They offer basic elements on the knowledge of the genetic diversity of the species. However, the study could be extended to C. zillii populations throughout the lake and rivers.
Author Keywords: Coptodon zillii, microsatellite markers, diversity, heterozygote, polymorphism, Lake Sélingué, Mali.
Abstract: (french)
Le barrage hydroélectrique de Sélingué est construit sur la rivière Sankarani au Mali. C’est une zone de production halieutique regorgeant de nombreuses espèces ichtyennes parmi lesquelles Coptodon zillii. L’espèce a été retenue dans le cadre de l’étude de la diversité génétique. L’étude a touché 120 spécimens provenant de deux débarcadères, Carrière dans la zone du lac et Faraba près de la rivière Sankarani. Chaque échantillon a fait l’objet d’extraction d’ADN à partir d’une portion de nageoire caudale. Dix marqueurs microsatellites ont été utilisés et la diversité génétique de chaque locus, analysée. Les résultats ont montré un nombre d’allèles variant de 2 à 5 par marqueurs avec une moyenne de 2,9. Les loci étaient polymorphes à 70% au seuil de 95%. Au total, 29 allèles ont été observés pour l’ensemble des échantillons avec 2 groupes sur le dendrogramme. Le groupe I est constitué de 5% des échantillons de Faraba et le groupe II des échantillons de Carrière et de Faraba à 95%. Dans le groupe II, il existe une séparation en fonction des débarcadères avec une faible différentiation entre les échantillons des deux sites. L’hétérozygotie attendue (He=0,35) est inférieure à celle observée (Ho=0,69), traduisant un excès d’hétérozygotie, avec une absence de consanguinité et un échange de gènes moins important entre les spécimens des deux zones. Ces résultats montrent un polymorphisme élevé et une diversité génétique chez les échantillons étudiés. Ils offrent des éléments de base sur la connaissance de la diversité génétique de l’espèce. Cependant, l’étude pourrait être étendue aux populations de C. zillii de l’ensemble du lac et cours d’eau.
Author Keywords: Coptodon zillii, marqueurs microsatellites, diversité, hétérozygote, polymorphisme, lac de Sélingué, Mali.
How to Cite this Article
Nanourou Dembélé, Youssouf Sanogo, Adama Konaté, Ramata Diop, Hama Cisse, Fassé Samaké, and Diakaridia Traoré, “Genetic diversity and polymorphism of Coptodon zillii from lake Selingue (Mali) using microsatellite markers,” International Journal of Innovation and Scientific Research, vol. 70, no. 1, pp. 1–9, December 2023.
